MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydophila pneumoniae TW-183

Total Repeats: 25567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005043	ATG	2	6	16	21	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241336
2	NC_005043	CCT	2	6	32	37	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33241336
3	NC_005043	AGC	2	6	42	47	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241336
4	NC_005043	CTT	2	6	70	75	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241336
5	NC_005043	AGCA	2	8	98	105	50 %	0 %	25 %	25 %	33241336
6	NC_005043	ATA	2	6	128	133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241336
7	NC_005043	CA	3	6	168	173	50 %	0 %	0 %	50 %	33241336
8	NC_005043	AAT	2	6	181	186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241336
9	NC_005043	ATTTA	2	10	187	196	40 %	60 %	0 %	0 %	33241336
10	NC_005043	AG	3	6	248	253	50 %	0 %	50 %	0 %	33241336
11	NC_005043	AAT	2	6	265	270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241336
12	NC_005043	T	6	6	327	332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005043	TAA	2	6	339	344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005043	T	7	7	349	355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005043	CTT	2	6	363	368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_005043	TC	3	6	377	382	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_005043	GTT	2	6	416	421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241337
18	NC_005043	AAG	2	6	423	428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241337
19	NC_005043	AAC	2	6	442	447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241337
20	NC_005043	AG	3	6	465	470	50 %	0 %	50 %	0 %	33241337
21	NC_005043	T	6	6	494	499	0 %	100 %	0 %	0 %	33241337
22	NC_005043	TCTT	2	8	512	519	0 %	75 %	0 %	25 %	33241337
23	NC_005043	GAA	2	6	597	602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241338
24	NC_005043	CTT	2	6	667	672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241338
25	NC_005043	AAG	2	6	697	702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241338
26	NC_005043	TGA	2	6	719	724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241338
27	NC_005043	GTA	2	6	756	761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241338
28	NC_005043	GA	3	6	776	781	50 %	0 %	50 %	0 %	33241338
29	NC_005043	T	7	7	972	978	0 %	100 %	0 %	0 %	33241339
30	NC_005043	ATAGA	2	10	980	989	60 %	20 %	20 %	0 %	33241339
31	NC_005043	AGGT	2	8	1004	1011	25 %	25 %	50 %	0 %	33241339
32	NC_005043	ATA	2	6	1127	1132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241339
33	NC_005043	ACA	2	6	1153	1158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241339
34	NC_005043	ACC	2	6	1188	1193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33241339
35	NC_005043	TGT	2	6	1206	1211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241339
36	NC_005043	AGAA	2	8	1212	1219	75 %	0 %	25 %	0 %	33241339
37	NC_005043	A	6	6	1222	1227	100 %	0 %	0 %	0 %	33241339
38	NC_005043	CAA	2	6	1280	1285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241339
39	NC_005043	TTC	2	6	1347	1352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241339
40	NC_005043	GGA	2	6	1414	1419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241339
41	NC_005043	GCA	2	6	1435	1440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241339
42	NC_005043	AGA	2	6	1548	1553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241339
43	NC_005043	ATG	2	6	1564	1569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241339
44	NC_005043	AG	3	6	1609	1614	50 %	0 %	50 %	0 %	33241339
45	NC_005043	TGA	2	6	1701	1706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241339
46	NC_005043	TCT	2	6	1721	1726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241339
47	NC_005043	GAAGGA	2	12	1744	1755	50 %	0 %	50 %	0 %	33241339
48	NC_005043	TGTGGA	2	12	1764	1775	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	33241339
49	NC_005043	TA	3	6	1803	1808	50 %	50 %	0 %	0 %	33241339
50	NC_005043	CTG	2	6	1823	1828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241339
51	NC_005043	TC	3	6	1914	1919	0 %	50 %	0 %	50 %	33241339
52	NC_005043	TGTCT	2	10	1974	1983	0 %	60 %	20 %	20 %	33241339
53	NC_005043	GA	3	6	1987	1992	50 %	0 %	50 %	0 %	33241339
54	NC_005043	TAT	2	6	2002	2007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241339
55	NC_005043	GTGC	2	8	2023	2030	0 %	25 %	50 %	25 %	33241339
56	NC_005043	AGG	2	6	2219	2224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241339
57	NC_005043	CAA	2	6	2269	2274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241339
58	NC_005043	GTT	2	6	2350	2355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241339
59	NC_005043	AGG	2	6	2358	2363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241339
60	NC_005043	TC	3	6	2593	2598	0 %	50 %	0 %	50 %	33241340
61	NC_005043	TAT	2	6	2678	2683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241340
62	NC_005043	GAG	2	6	2686	2691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241340
63	NC_005043	AGA	2	6	2753	2758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241340
64	NC_005043	CTT	2	6	2887	2892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241340
65	NC_005043	GAA	2	6	2937	2942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241340
66	NC_005043	AAC	2	6	3067	3072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241340
67	NC_005043	CTAC	2	8	3133	3140	25 %	25 %	0 %	50 %	33241340
68	NC_005043	GAAAA	2	10	3153	3162	80 %	0 %	20 %	0 %	33241340
69	NC_005043	A	7	7	3159	3165	100 %	0 %	0 %	0 %	33241340
70	NC_005043	AG	3	6	3185	3190	50 %	0 %	50 %	0 %	33241340
71	NC_005043	TA	3	6	3252	3257	50 %	50 %	0 %	0 %	33241340
72	NC_005043	T	6	6	3378	3383	0 %	100 %	0 %	0 %	33241340
73	NC_005043	ATG	2	6	3579	3584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241340
74	NC_005043	GAG	2	6	3606	3611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241340
75	NC_005043	GCT	2	6	3632	3637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241340
76	NC_005043	GGT	2	6	3680	3685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33241340
77	NC_005043	CAG	2	6	3772	3777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241340
78	NC_005043	CTC	2	6	3784	3789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33241340
79	NC_005043	GAAC	2	8	3800	3807	50 %	0 %	25 %	25 %	33241340
80	NC_005043	GTCT	2	8	3851	3858	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_005043	A	6	6	3860	3865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_005043	T	7	7	3900	3906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005043	CTAC	2	8	3965	3972	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_005043	GCTT	2	8	4062	4069	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_005043	TCTTAT	2	12	4070	4081	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_005043	T	6	6	4158	4163	0 %	100 %	0 %	0 %	33241341
87	NC_005043	CTT	2	6	4191	4196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241341
88	NC_005043	CTA	2	6	4203	4208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241341
89	NC_005043	AGA	2	6	4225	4230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241341
90	NC_005043	TAAA	2	8	4341	4348	75 %	25 %	0 %	0 %	33241341
91	NC_005043	ATC	2	6	4392	4397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241341
92	NC_005043	TAA	2	6	4411	4416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241341
93	NC_005043	AAGG	2	8	4436	4443	50 %	0 %	50 %	0 %	33241341
94	NC_005043	TTG	2	6	4453	4458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241341
95	NC_005043	CT	3	6	4502	4507	0 %	50 %	0 %	50 %	33241341
96	NC_005043	A	6	6	4555	4560	100 %	0 %	0 %	0 %	33241341
97	NC_005043	TAG	2	6	4653	4658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241341
98	NC_005043	TTC	2	6	4717	4722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241341
99	NC_005043	TGATAT	2	12	4816	4827	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	33241341
100	NC_005043	ACT	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241341
101	NC_005043	AGGG	2	8	4887	4894	25 %	0 %	75 %	0 %	33241341
102	NC_005043	CTGT	2	8	4896	4903	0 %	50 %	25 %	25 %	33241341
103	NC_005043	AGT	2	6	4922	4927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241341
104	NC_005043	GAAA	2	8	4976	4983	75 %	0 %	25 %	0 %	33241341
105	NC_005043	AGG	2	6	5038	5043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241341
106	NC_005043	AAT	2	6	5060	5065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241341
107	NC_005043	AT	3	6	5064	5069	50 %	50 %	0 %	0 %	33241341
108	NC_005043	CAG	2	6	5136	5141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241341
109	NC_005043	CATC	2	8	5197	5204	25 %	25 %	0 %	50 %	33241341
110	NC_005043	TTA	2	6	5442	5447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241341
111	NC_005043	GATA	2	8	5566	5573	50 %	25 %	25 %	0 %	33241341
112	NC_005043	CAG	2	6	5598	5603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241341
113	NC_005043	TTA	2	6	5607	5612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	33241341
114	NC_005043	CT	3	6	5726	5731	0 %	50 %	0 %	50 %	33241341
115	NC_005043	CTG	2	6	5766	5771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241341
116	NC_005043	TTC	2	6	5858	5863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241341
117	NC_005043	ATAAA	2	10	5868	5877	80 %	20 %	0 %	0 %	33241341
118	NC_005043	AAG	2	6	5898	5903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241341
119	NC_005043	ACAG	2	8	5989	5996	50 %	0 %	25 %	25 %	33241341
120	NC_005043	TTC	2	6	6029	6034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241341
121	NC_005043	ATA	2	6	6072	6077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241341
122	NC_005043	AAT	2	6	6101	6106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241341
123	NC_005043	TAG	2	6	6154	6159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241341
124	NC_005043	CAA	2	6	6181	6186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33241341
125	NC_005043	TC	3	6	6289	6294	0 %	50 %	0 %	50 %	33241341
126	NC_005043	AAG	2	6	6295	6300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241341
127	NC_005043	TTC	2	6	6303	6308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33241341
128	NC_005043	T	6	6	6331	6336	0 %	100 %	0 %	0 %	33241341
129	NC_005043	CCA	2	6	6354	6359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33241341
130	NC_005043	TTG	2	6	6418	6423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241341
131	NC_005043	GGAG	2	8	6437	6444	25 %	0 %	75 %	0 %	33241341
132	NC_005043	GAC	2	6	6544	6549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241341
133	NC_005043	GCT	2	6	6704	6709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241341
134	NC_005043	GCA	2	6	6743	6748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241341
135	NC_005043	GCC	2	6	6840	6845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33241341
136	NC_005043	TATAA	2	10	6860	6869	60 %	40 %	0 %	0 %	33241341
137	NC_005043	TG	3	6	6911	6916	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_005043	TG	3	6	6977	6982	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_005043	GAG	2	6	7120	7125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_005043	CT	3	6	7259	7264	0 %	50 %	0 %	50 %	33241342
141	NC_005043	T	6	6	7328	7333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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266	NC_005043	GTAC	2	8	12712	12719	25 %	25 %	25 %	25 %	33241345
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273	NC_005043	GGCA	2	8	12944	12951	25 %	0 %	50 %	25 %	33241345
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277	NC_005043	GCT	2	6	13017	13022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241345
278	NC_005043	GAT	2	6	13027	13032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241345
279	NC_005043	TGC	2	6	13037	13042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33241345
280	NC_005043	TGA	2	6	13044	13049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33241345
281	NC_005043	GAA	2	6	13053	13058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241345
282	NC_005043	TAA	2	6	13080	13085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33241345
283	NC_005043	AGC	3	9	13089	13097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33241345
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285	NC_005043	TA	3	6	13259	13264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_005043	TAG	2	6	13266	13271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
287	NC_005043	CAC	2	6	13308	13313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
288	NC_005043	C	13	13	13350	13362	0 %	0 %	0 %	100 %	33241346
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291	NC_005043	CT	3	6	13456	13461	0 %	50 %	0 %	50 %	33241346
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299	NC_005043	GAG	2	6	13638	13643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
300	NC_005043	AGA	2	6	13663	13668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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407	NC_005043	TCT	2	6	18293	18298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
408	NC_005043	A	6	6	18414	18419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
409	NC_005043	ACA	2	6	18468	18473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
410	NC_005043	CTTT	2	8	18525	18532	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
411	NC_005043	ATCT	2	8	18533	18540	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
412	NC_005043	GAAA	2	8	18550	18557	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
413	NC_005043	A	7	7	18570	18576	100 %	0 %	0 %	0 %	33241350
414	NC_005043	GTT	2	6	18578	18583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33241350
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426	NC_005043	CTTT	2	8	18974	18981	0 %	75 %	0 %	25 %	33241350
427	NC_005043	AATT	2	8	19108	19115	50 %	50 %	0 %	0 %	33241350
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463	NC_005043	AGA	2	6	21190	21195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
464	NC_005043	CT	3	6	21215	21220	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
465	NC_005043	TAG	2	6	21301	21306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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484	NC_005043	GAG	2	6	22273	22278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33241353
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496	NC_005043	TCTCG	2	10	22800	22809	0 %	40 %	20 %	40 %	33241353
497	NC_005043	ACT	2	6	22824	22829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33241353
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499	NC_005043	AAG	2	6	22896	22901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33241353
500	NC_005043	A	6	6	22928	22933	100 %	0 %	0 %	0 %	33241353

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